Defekti koji se mogu pojaviti u području zavarivanja pod vodom uključuju pore, termalne pukotine i podrezine.

1. Mjehurići. Mjehurići se uglavnom javljaju u centru vara. Glavni razlog je taj što je vodonik još uvijek skriven u zavarenom metalu u obliku mjehurića. Stoga su mjere za otklanjanje ovog defekta prvo uklanjanje rđe, ulja, vode i vlage sa žice za zavarivanje i zavarenih spojeva, i drugo, dobro isušivanje fluksa kako bi se uklonila vlaga. Osim toga, povećanje struje, smanjenje brzine zavarivanja i usporavanje brzine očvršćavanja rastopljenog metala je također vrlo efikasno.

2. Sumporne pukotine (pukotine uzrokovane sumporom). Prilikom zavarivanja ploča sa jakim trakama za odvajanje sumpora (naročito čelik mekog ključanja), sulfidi u vrpci za odvajanje sumpora ulaze u metal šava i uzrokuju pukotine. Razlog je to što postoji niska tačka topljenja željeznog sulfida u pojasu segregacije sumpora i vodonika u čeliku. Stoga, kako bi se spriječila ova situacija, efikasno je koristiti polu-ubijeni čelik ili ugašeni čelik s manje traka za segregaciju sumpora. Drugo, čišćenje i sušenje površine zavara i fluksa su takođe veoma neophodni.

3. Termičke pukotine. Kod zavarivanja pod vodom u zavaru se mogu pojaviti termalne pukotine, posebno u lukovima na početku i na kraju luka. Da bi se eliminisale takve pukotine, jastučići se obično postavljaju na početku i na kraju luka, a na kraju zavarivanja ploča spiralno zavarena cijev se može preokrenuti i zavariti u preklop. Termičke pukotine se lako javljaju kada je naprezanje šava veoma veliko ili je metal šava veoma visok.

4. Uključivanje šljake. Uključivanje šljake znači da dio šljake ostaje u metalu šava.

5. Loša penetracija. Preklapanje unutrašnjeg i vanjskog metala vara nije dovoljno, a ponekad nije zavareno. Ova situacija se naziva nedovoljna penetracija.

6. Undercut. Podrezivanje je žljeb u obliku slova V na rubu vara duž središnje linije vara. Podrezivanje je uzrokovano neprikladnim uvjetima kao što su brzina zavarivanja, struja i napon. Među njima, veća je vjerovatnoća da će previsoka brzina zavarivanja uzrokovati defekte podrezivanja nego neodgovarajuću struju.